Tidak jauh dari Universitas Kristen Petra, tepatnya di Jl Siwalankerto Utara 56, kini berdiri Pondok Pesantren (Ponpes) Amanatul Ummah. Ponpes yang dibagun di atas latah seluas 5.000 meter persegi itu, sengaja dibangun di kawasan perkampungan tengah kota yang padat penduduknya, untuk membina keimanan umat Islam sekitarnya. Diungkapkan Ketua Yayasan dan pengasuh Ponpes Amanatul Ummah KH Asep Saifuddin Chalim MA, dasar pendirian Ponpes Amanatul Ummah adalah ikut mencerdaskan kehidupan bangsa, mempersiapkan kader-kader muslim yang tangguh dan berkualitas, siap berdrama bakti untuk agama, bangsa dan negara. Juga mempersiapkan siswa yang mempunyai pengetahuan tentang agama, ilmu pasti, dan bahasa Arab maupun Inggris. Saat ini, Ponpes Amantul Ummah memiliki sekitar 400 orang santri. Mereka belajar di jenjang pendidikan MTs dan MA Unggulan PP Amanatul Ummah. Tidak hanya itu, menurut KH Asep, para siswa MTs dan MA ini juga diajari membaca kitab kuning.